已知整個(gè)高粱籽粒的結(jié)構(gòu)特征會(huì)影響最終使用質(zhì)量,但對該結(jié)構(gòu)的傳統(tǒng)評(píng)估是二維的(即,籽粒的橫截面)。目前的技術(shù)為考慮谷物的三維結(jié)構(gòu)特征提供了可能性。X射線計(jì)算機(jī)斷層成像(CT)提供了這樣一種機(jī)會(huì),可以從谷粒穎果中無損地提取定量數(shù)據(jù),然后這些數(shù)據(jù)可以與最終使用質(zhì)量相關(guān)。
CT成像和數(shù)據(jù)采集流水線概述
從籽粒高粱穎果的CT掃描中提取出表型測量值。胚體積、胚乳硬度、胚乳質(zhì)地、胚乳體積、果皮體積和籽粒體積的表型變異較大。CT得出的估計(jì)值與地面實(shí)況測量有很強(qiáng)的相關(guān)性,從而能夠識(shí)別出具有優(yōu)越結(jié)構(gòu)特征的基因型。
19個(gè)基因型的高粱籽粒結(jié)構(gòu)CT估計(jì)值中與因子相關(guān)的百分比方差。復(fù)制指的是獨(dú)立的CT掃描,而行和列指的是CT機(jī)內(nèi)的空間位置
本文提出了一種表型流水線,用于量化籽粒高粱穎果的三維結(jié)構(gòu)特征,從而提高了以前難以測量的性狀的處理效率。將這一工作流程調(diào)整到其他小種子作物上是可能的,這為科學(xué)家以非破壞性的方式研究谷物提供了新的獨(dú)特機(jī)會(huì),最終將導(dǎo)致最終使用質(zhì)量的提高。
來源:Plant Methods.Application of X-ray computed tomography to analyze the structure of sorghum grain.Daniel Crozier, Oscar Riera-Lizarazu & William L. Rooney
https://plantmethods.biomedcentral.com/articles/10.1186/s13007-022-00837-7